Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF559Q9BR84 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF559Q9BR84 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms