Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPIN3Q9BQK8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms