Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCK3Q9BQ16 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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SPOCK3Q9BQ16 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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SPOCK3Q9BQ16 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SPOCK3Q9BQ16 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SPOCK3Q9BQ16 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK3Q9BQ16 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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