Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPS8Q99627 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms