Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OPALINQ96PE5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OPALINQ96PE5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms