Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDC1Q96MU7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDC1Q96MU7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms