Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms