Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC7Q96M83 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms