Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf72Q96LT7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms