Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms