Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNRF4Q8WWF5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms