Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC107Q8WV48 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC107Q8WV48 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms