Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ZNF248Q8NDW4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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