Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms