Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTROBQ8N137 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTROBQ8N137 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms