Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMNTD2Q8IXW0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms