Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCBE1Q6UXH8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms