Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms