Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCAF6Q58WW2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCAF6Q58WW2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms