Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL12Q53G59 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms