Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM259Q4ZIN3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms