Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC153Q494R4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC153Q494R4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms