Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TWISTNBQ3B726 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms