Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
KLHL40Q2TBA0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL40Q2TBA0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms