Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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