Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDB1Q16531 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDB1Q16531 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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