Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SSX1Q16384 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SSX1Q16384 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SSX1Q16384 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SSX1Q16384 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SSX1Q16384 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX1Q16384 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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