Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF56Q15929 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms