Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC1A5Q15758 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms