Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYCP1Q15431 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms