Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TLR1Q15399 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms