Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCOLCEQ15113 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms