Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCF4Q15080 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms