Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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BRD3Q15059 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRD3Q15059 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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