Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms