Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM25Q14258 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms