Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBFBQ13951 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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