Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP1Q13835 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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