Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PMS2P3Q13401 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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