Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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