Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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