Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TRAF1Q13077 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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