Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms