Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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BNIP1Q12981 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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