Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC10A2Q12908 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms