Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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