Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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KCNMA1Q12791 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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KCNMA1Q12791 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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KCNMA1Q12791 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNMA1Q12791 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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