Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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