Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYCNQ0VAF6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYCNQ0VAF6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms