Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC15Q0P6D6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms